Трошкови неусклађености су додатни трошкови које предузеће има када не успе да испуни захтеве квалитета за своје производе. Ови трошкови настају као резултат неуспеха у производном процесу. Резултирајући трошкови састоје се од трошкова прераде, отпада и застоја у предузећу, као и потраживања гаранције, трошкова опозива и изгубљене продаје.