Извештај о функционалним трошковима користи се да би се показало како настају трошкови за свако функционално подручје непрофитног ентитета. Функционална подручја обично укључују следеће:
Менаџмент и администрација
Прикупљање средстава
Програми
Ова презентација се појављује као матрица, где је свако функционално подручје наведено у горњем реду извештаја, а врсте расхода наведене су лево. Извештај о функционалним трошковима сматра се помоћним извештајем који се може додати примарном скупу финансијских извештаја. Дакле, то није неопходно (осим ако прималац финансијских извештаја то не захтева), али може садржати корисне информације.