Систем контрола не пружа апсолутно уверење да ће контролни циљеви организације бити испуњени. Уместо тога, постоји неколико инхерентних ограничења у било ком систему која смањују ниво сигурности. Ова инхерентна ограничења су следећа:
Договор. Двоје или више људи којима је систем контроле намењен да пазе једни на друге могли би уместо тога да дођу у заобилажење система.
Људска грешка. Особа која је укључена у контролни систем може једноставно да погреши, можда заборавивши да користи контролни корак. Или, особа не разуме како се користи контролни систем или не разуме упутства повезана са системом. То може бити узроковано додељивањем задатка погрешној особи.
Замена управљања. Неко у менаџерском тиму који за то има овлашћење може да замени било који аспект система контроле у своју личну корист.
Недостаје раздвајање дужности. Контролни систем је можда дизајниран са недовољном поделом дужности, тако да једна особа може ометати његов правилан рад.
Сходно томе, мора се прихватити да ниједан систем интерних контрола није савршен. Увек постоји начин на који може пропасти или га заобићи.
