Рачуноводство фондова је систем рачуноводства који користе непрофитни субјекти за праћење износа готовине додељене различитим наменама и коришћења те готовине. Намера рачуноводства фондова није да прати да ли је ентитет остварио добит, јер то није сврха непрофитне организације. Стога је фокус рачуноводства фондова на одговорности, а не на профитабилности.
Непрофитна организација може да користи одређени број средстава, од којих је свако постављено са посебним скупом рачуна и билансом стања, тако да корисници могу утврдити у којој мери је готовина употребљена за предвиђену намену. На пример, градска влада може имати одвојена средства за поправке улица, полицију, пречишћавање канализације и школе.
Средства су намењена ограничавању употребе за коју се одређени новчани токови могу користити. На пример, ако зоолошки врт прима донације намењене искључиво изложбама животиња, тада се новац евидентира у фонду изложби животиња и не може се потрошити на било које друге активности, попут општег одржавања. Прихватајући овај приступ, организација има бољу контролу над употребом за коју се користи прилив готовине. Такође, оперативни резултати програма могу се упоредити са издацима који долазе из повезаног фонда, тако да присталице непрофитне организације могу проценити у којој мери ентитет испуњава своје циљеве.
За сваки фонд може се утврдити засебан буџет. Чинећи то, менаџер непрофитне организације може пратити износ расхода у односу на ниво расположивих средстава и управљати нивоом расхода тако да се услуге које се пружају преко фонда обављају током читаве буџетске године без покретања дефицита у износу расположива средства.
Примери врста субјеката који могу да користе рачуноводство фондова су:
Уметничке основе
Добротворне организације
Цркве
Колеџи и универзитети
Владе
Болнице